MEROPS
外觀
| 內容 | |
|---|---|
| 說明(描述) | MEROPS: the database of proteolytic enzymes, their substrates and inhibitors. |
| 相關信息 | |
| 研究中心 | 維康桑格研究所 |
| 作者(創始人) | Neil D Rawlings |
| 主要參考文獻(引用) | Rawlings & al. (2012)[1] |
| 發布日期 | 2010 |
| 訪問 | |
| 網站 | http://merops.sanger.ac.uk |
MEROPS是一個關於蛋白酶(或稱為肽酶)及其抑制劑的在線網絡資料庫[2]。它對蛋白酶的分類方案由Rawlings & Barrett在1993年提出[3],對蛋白抑制劑的由Rawlings et al.在2004年提出[4]。最新版本MEROPS 12.0於2017年9月發布[5]。
總覽
[編輯]分類基於三級的和一級的結構層面的相似性。比較僅限於直接參與反應的那部分序列,其在肽酶的情況下必須包含活性位點,並且對於蛋白質抑制劑而言為反應位點。分類是分層次的:序列被編組成家族(families),家族組成氏族(clans)。 每個肽酶,家族和氏族都有一個獨特的標識符。
另見
[編輯]參考文獻
[編輯]- ^ Rawlings, Neil D; Barrett Alan J; Bateman Alex. MEROPS: the database of proteolytic enzymes, their substrates and inhibitors. Nucleic Acids Res. (England). Jan 2012, 40 (Database issue): D343–50. PMC 3245014
. PMID 22086950. doi:10.1093/nar/gkr987 (eng).
- ^ Rawlings ND, Barrett AJ, Bateman A. MEROPS: the peptidase database. Nucleic Acids Res. January 2010, 38 (Database issue): D227–33. PMC 2808883
. PMID 19892822. doi:10.1093/nar/gkp971.
- ^ Rawlings, N.D. & Barrett, A.J. (1993) Evolutionary families of peptidases. Biochem J 290, 205-218.
- ^ Rawlings, N.D., Tolle, D.P. & Barrett, A.J. (2004) Evolutionary families of peptidase inhibitors. Biochem J 378, 705-716.
- ^ What's New in MEROPS?. [2018-03-23]. (原始內容存檔於2020-06-30).